À 35 km de Niort, 50 km de La Rochelle, 110 km de Poiters et 110 km de Nantes, reliée aux villes de Nantes, Rennes, Angers, Niort et Bordeaux par les autoroutes A83 et A87.
Au sud de la Vendée, Fontenay-le-Comte se situe au carrefour de trois types de paysages
caractéristiques : le Marais Poitevin, le Bocage nord-Vendée et la plaine céréalière de Niort.
Malgré sa faible alttude (entre 5 et 30 m), le relief de Fontenay-le-Comte est relatvement vallonné, excepté le quarter des Loges situé sur une zone alluvionnaire.
Sous-préfecture, chef-lieu d’arrondissement et de canton, Fontenay-le-Comte est la ville centre de la Communauté de Communes du
Pays de Fontenay-Vendée qui regroupe 26 communes.
